Обратите внимание на то, что на вход штатного нода можно не подавать никаких значений, в этом случае нод примет по умолчанию нуль. Штатный нод для построения точки без входных данных построит точку в начале координат. В случае задания точки через код DesignScript (в дальнейшем для краткости будем писать DS) необходимо подавать на вход все данные.
Также обращаю внимание на префикс Autodesk в коде DS, его стали вводить с недавних пор, раньше писали просто Point.ByCoordinates, но в дальнейшем в Dynamo стали проникать элементы аналогичной программы Grasshopper, работающей с системой трехмерного моделирования Rhinoceros (Rhino) и пришлось ввести разделение операторов. В дальнейшем вы можете увидеть команды с префиксом Rhino.